Eso te pasa con lluvia o sin más? A mi en un coche que tuve le entró una vez agua a los pies del copiloto cuando circulaba con fuertes lluvias. Por lo visto tenía taponada la zona del desagüe donde el motor.
Es para ir descartando y si nos pones en contexto a ver si alguien puede saber a que es debido.
O como te ha dicho Manugonrez si puede ser por el clima.